Les scientifiques cartographient les contrôleurs génétiques dans les maladies cardiaques

        

 Les scientifiques cartographient les contrôleurs génétiques dans la maladie cardiaque "title =" Les scientifiques cartographient les contrôleurs génétiques dans les maladies cardiaques "/></div><p>        </p><p>Les chercheurs ont développé une carte en 3D des interactions génétiques qui jouent un rôle clé dans les maladies cardiovasculaires, une étude des rapports eLife.</p><p>La carte aidera les chercheurs à identifier les gènes les plus importants sur lesquels se concentrer pour le développement de nouveaux traitements contre les crises cardiaques, l'insuffisance cardiaque et les troubles du rythme cardiaque.</p><p>Plus de 500 variants génétiques ont été associés à un risque accru de maladie cardiovasculaire.</p><p> </p><p> </p><p>Mais la plupart se trouvent dans des parties dites «non codantes» du génome, ce qui signifie qu'elles ne codent pas pour une molécule de protéine particulière.</p><p>Il est donc difficile pour les chercheurs de comprendre l'importance de ces variantes génétiques parce que, jusqu'à maintenant, il n'y avait aucun moyen d'étudier leur fonction.</p><p>"Les signatures génétiques les plus fortes associées à des maladies humaines complexes, y compris de nombreuses maladies cardiovasculaires, se situent en dehors des gènes, dispersés dans les vastes 98% du génome" non codant ", explique Lindsey Montefiori, auteur principal, Étudiant diplômé à l'Université de Chicago, États-Unis.</p><p>"Ce que nous pensons qui se passe est que ces mutations affectent la fonction des" commutateurs "de gènes, appelés amplificateurs, qui déterminent où, quand et à quel niveau chaque gène devrait être allumé."</p><p>Ces amplificateurs peuvent être situés n'importe où dans le génome et se trouvent souvent à une distance considérable des gènes qu'ils contrôlent.</p><div style=
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Mais parce que l'ADN forme des boucles à l'intérieur des cellules, les activateurs peuvent se connecter physiquement aux gènes qu'ils contrôlent et affiner leur activité.

Il est récemment devenu possible de cartographier ces amplificateurs à leurs gènes cibles en utilisant une technique appelée capture de promoteur à haute résolution, qui utilise la région de l'amplificateur comme «appât» pour attraper son gène cible.

L'équipe a ajouté une étape supplémentaire à cela, de sorte qu'ils ont seulement «capturé» une région du génome qui contient des gènes codants.

Cela leur a permis de cartographier chaque mutation de son gène cible dans les cellules cardiaques humaines et d'examiner le câblage précis de tous les amplificateurs potentiels contrôlant chaque gène.

Ils ont examiné plus de 10 000 mutations génétiques liées à des maladies cardiovasculaires et ont découvert que 1 999 d'entre eux établissaient un contact physique avec 347 gènes cibles dans les cellules cardiaques.

Quand ils ont étudié les gènes plus loin, ils ont trouvé que ceux-ci étaient bien connus pour leurs rôles dans la fonction cardiaque.

Parce que les trois maladies analysées impliquent des processus différents, l'équipe a ensuite étudié les interactions entre les amplificateurs avec des gènes dans d'autres types de cellules qui pourraient être impliqués dans les maladies cardiovasculaires.

Ici, ils ont trouvé que des mutations liées à des crises cardiaques capturé un gène cible impliqué dans la régulation du cholestérol, et des mutations dans l'insuffisance cardiaque ont arraché un gène connu pour être important dans la maladie coronarienne.

"La compréhension incomplète de la régulation des gènes à long terme est un obstacle majeur à la traduction des variantes génétiques en compréhension de la biologie des maladies", explique l'auteur principal Marcelo Nóbrega, professeur de génétique humaine à l'Université de Chicago.

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"Notre carte en 3D des interactions gène-enhancer dans les cellules cardiaques humaines aidera à guider les chercheurs vers les gènes causaux les plus probables sous-jacents au risque cardiovasculaire accru, et pourrait conduire à de nouvelles stratégies de traitement et de prévention."

 

 

        

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